Analisis Modifikasi Struktur Amoksisilin Dengan Metode Molecular Docking Dan Molecular Dynamic

Pradana Abdul Mashel, (NIM. 1062011016) (2025) Analisis Modifikasi Struktur Amoksisilin Dengan Metode Molecular Docking Dan Molecular Dynamic. Other thesis, Universitas Bangka Belitung.

[thumbnail of HALAMAN DEPAN] Text (HALAMAN DEPAN)
HALAMAN DEPAN.pdf - Accepted Version
Restricted to Registered users only
Download (1MB)
[thumbnail of BAB I] Text (BAB I)
BAB I.pdf - Accepted Version
Restricted to Registered users only
Download (347kB)
[thumbnail of BAB II] Text (BAB II)
BAB II.pdf - Accepted Version
Restricted to Registered users only
Download (899kB)
[thumbnail of BAB V] Text (BAB V)
BAB V.pdf - Accepted Version
Restricted to Registered users only
Download (265kB)
[thumbnail of BAB III] Text (BAB III)
BAB III.pdf - Accepted Version
Restricted to Registered users only
Download (261kB)
[thumbnail of BAB IV] Text (BAB IV)
BAB IV.pdf - Accepted Version
Restricted to Registered users only
Download (1MB)
[thumbnail of BAB V] Text (BAB V)
BAB V.pdf - Accepted Version
Restricted to Registered users only
Download (265kB)
[thumbnail of LAMPIRAN] Text (LAMPIRAN)
LAMPIRAN.pdf - Accepted Version
Restricted to Registered users only
Download (780kB)
[thumbnail of DAFTAR PUSTAKA] Text (DAFTAR PUSTAKA)
DAFTAR PUSTAKA.pdf - Accepted Version
Restricted to Registered users only
Download (362kB)

Abstract

Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis interaksi antara modifikasi amoksisilin dengan protein bakteri Staphylococcus aureus dan Escherichia coli menggunakan metode Molecular Docking dan Molecular Dynamics. Resistensi bakteri seperti Staphylococcus aureus dan Escherichia coli terus menjadi masalah global yang signifikan, sehingga diperlukan pendekatan inovatif untuk pengembangan obat yang lebih efektif. Amoksisilin, salah satu antibiotik yang banyak digunakan, dimodifikasi strukturnya untuk meningkatkan efektivitas dalam mengatasi resistensi bakteri. Penelitian ini menggunakan desain obat berbantuan komputer, yang melibatkan simulasi interaksi molekul antara amoksisilin yang dimodifikasi dengan situs aktif protein target dari kedua bakteri tersebut. Hasil Molecular Docking menunjukkan bahwa modifikasi amoksisilin memiliki afinitas yang signifikan terhadap protein dari Staphylococcus aureus dan Escherichia coli, dengan nilai afinitas terbaik mencapai -9.378 untuk Staphylococcus aureus dan -8.097 untuk Escherichia coli. Hal ini mengindikasikan potensi interaksi yang kuat antara modifikasi amoksisilin dengan reseptor bakteri. Selain itu, simulasi Molecular Dynamics yang dianalisis melalui parameter RMSD, RMSF, dan radius of gyration (Rg) menunjukkan kestabilan kompleks ligan-reseptor. Kompleks tetap stabil selama simulasi 15 ps hingga 100 ps, menunjukkan bahwa modifikasi amoksisilin tidak hanya berinteraksi dengan baik, tetapi juga mempertahankan kestabilannya dalam lingkungan simulasi.

Item Type: Thesis (Other)
Uncontrolled Keywords: modifikasi amoksisilin; Staphylococcus aureus; Escherichia coli; Molecular Docking; Molecular Dynamics; resistensi bakteri.
Subjects: Q Sains > QD Chemistry
Divisions: FAKULTAS SAINS DAN TEKNIK > KIMIA > SKRIPSI
Depositing User: Mr Arja Kusuma
Date Deposited: 24 Oct 2025 04:22
Last Modified: 24 Oct 2025 04:22
URI: https://repository.ubb.ac.id/id/eprint/12596

Actions (login required)

View Item View Item