Identifikasi Ikan Tempalak Biji Labu (Parosphromenus sp) Asal Sungai Lenggang Belitung Timur Dengan Menggunakan DNA Barcoding

Amalia Wijayanti, (NIM. 2062011037) (2024) Identifikasi Ikan Tempalak Biji Labu (Parosphromenus sp) Asal Sungai Lenggang Belitung Timur Dengan Menggunakan DNA Barcoding. skripsi thesis, Universitas Bangka Belitung.

[thumbnail of HALAMAN DEPAN.pdf] Text
HALAMAN DEPAN.pdf
Restricted to Registered users only
Download (1MB)
[thumbnail of BAB I.pdf] Text
BAB I.pdf
Restricted to Registered users only
Download (426kB)
[thumbnail of BAB II.pdf] Text
BAB II.pdf
Restricted to Registered users only
Download (617kB)
[thumbnail of BAB III.pdf] Text
BAB III.pdf
Restricted to Registered users only
Download (529kB)
[thumbnail of BAB IV.pdf] Text
BAB IV.pdf
Restricted to Registered users only
Download (841kB)
[thumbnail of BAB V.pdf] Text
BAB V.pdf
Restricted to Registered users only
Download (407kB)
[thumbnail of DAFTAR PUSTAKA.pdf] Text
DAFTAR PUSTAKA.pdf
Restricted to Registered users only
Download (425kB)
[thumbnail of LAMPIRAN.pdf] Text
LAMPIRAN.pdf
Restricted to Registered users only
Download (714kB)

Abstract

Parosphromenus sp atau Ikan Tempalak Biji Labu yang ditemukan pada Sungai Lenggang Belitung Timur berpotensi sebagai komoditas ikan hias lokal yang dapat dipasarkan secara nasional maupun internasional. Penelitian ini bertujuan untuk identifikasi Ikan Tempalak Biji Labu (parosphromenus sp) asal sungai lenggang belitung timur dengan menggunakan metode DNA Barcoding. DNA barcoding
adalah suatu metode untuk identifikasi spesies dengan hanya mengandalkan satu atau beberapa gen pendek yang sudah standar dan mampu membedakan antara satu spesies dengan spesies yang lainya. Salah satu gen umum yang biasa untuk
mengidentifikasi ikan adalah gen Cythochrome C Oxydase subunit 1 (COI), salah satu gene yang terdapat pada DNA mitokondria. Gen COI Ikan Tempalak Biji Labu dieksraksi menggunakan kit extraction ZR Tissue & Insect DNA MiniPrep. Hasil eksraksi kemudian diamplifikasi secara in vitro menggunakan komposisi bahan yaitu Master mix, primer Fish F1 dan Fish R1, ekstrak DNA dan ddH2O dengan 35 kali siklus amplifikasi yang terdiri dari denaturasi pada suhu 94 °C selama 60 detik, Anneling pada suhu 52 °C selama 90 detik, ekstensi pada suhu 72 °C selama 60 detik, dan selanjutnya ekstensi akhir pada suhu 72 °C selama 5 menit, dan didiamkan pada suhu 12 °C. DNA hasil amplifikasi kemudian disekuensing untuk mendapatkan urutan basa nukleotida. Urutan basa nukleutida kemudian dianalisis menggunakan program BLAST pada NCBI Genbank untuk identifikasi spesiesnya. Dari sebanyak 581 urutan basa DNA Ikan Tempalak Biji Labu asal Belitung, sampel pertama didapatkan hasil dari Query Cover sebesar 99%, Per ident menunjukkan nilai 92,19%. Pada sampel kedua yaitu 99% Query Cover dan Per ident 93,43%. Sampel ketiga yaitu 99% Query Cover dan Per ident 93,43%. Sampel
keempat yaitu 100% Query Cover dan Per ident 93,98%. Sampel kelima yaitu 99% Query Cover dan Per ident 93,94%. Secara morfologi, Ikan Tempalak Biji Labu memiliki kedekatan dengan spesies Parosphromenus bintan.

Item Type: Thesis (skripsi)
Uncontrolled Keywords: Ikan Tempalak, Parosphromenus bintan, Belitung Timur, DNA Barcoding
Subjects: S Pertanian > SH Aquaculture. Fisheries. Angling
Divisions: SKRIPSI > Fakultas Pertanian, Perikanan dan Biologi > Akuakultur
Depositing User: Mrs Suci Rhomana Sari
Date Deposited: 27 Sep 2024 03:57
Last Modified: 27 Sep 2024 03:57
URI: https://repository.ubb.ac.id/id/eprint/10272

Actions (login required)

View Item View Item